Protein–RNA interactions for Protein: O08542

Efna4, Ephrin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna4O08542 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna4O08542 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efna4O08542 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna4O08542 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna4O08542 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna4O08542 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna4O08542 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna4O08542 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna4O08542 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna4O08542 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna4O08542 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms