Protein–RNA interactions for Protein: J3QNX5

Shisa8, Cysteine-knot AMPAR-modulating protein 39, mousemouse

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa8J3QNX5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa8J3QNX5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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