Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21060J3KMU4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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