Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn20G5E8X0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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