Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tubgcp6G5E8P0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubgcp6G5E8P0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms