Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r12G5E8G1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r12G5E8G1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms