Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf148G3X9R7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf148G3X9R7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms