Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc9a3G3X939 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc9a3G3X939 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms