Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrna9G3X8Z7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrna9G3X8Z7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrna9G3X8Z7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrna9G3X8Z7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrna9G3X8Z7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrna9G3X8Z7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrna9G3X8Z7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrna9G3X8Z7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrna9G3X8Z7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrna9G3X8Z7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrna9G3X8Z7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrna9G3X8Z7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrna9G3X8Z7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrna9G3X8Z7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrna9G3X8Z7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrna9G3X8Z7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrna9G3X8Z7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrna9G3X8Z7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrna9G3X8Z7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrna9G3X8Z7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrna9G3X8Z7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrna9G3X8Z7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrna9G3X8Z7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrna9G3X8Z7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrna9G3X8Z7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrna9G3X8Z7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrna9G3X8Z7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrna9G3X8Z7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrna9G3X8Z7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrna9G3X8Z7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrna9G3X8Z7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrna9G3X8Z7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrna9G3X8Z7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrna9G3X8Z7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrna9G3X8Z7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrna9G3X8Z7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrna9G3X8Z7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms