Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
XntrpcF8VQM8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
XntrpcF8VQM8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XntrpcF8VQM8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms