Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colca2F8VPY8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms