Protein–RNA interactions for Protein: F6Z6Z2

3110082J24Rik, RIKEN cDNA 3110082J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms