Protein–RNA interactions for Protein: F6YCR7

Rhox13, Homeobox protein Rhox13, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox13F6YCR7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms