Protein–RNA interactions for Protein: F6X8D5

Gm42421, Predicted gene, 42421 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42421F6X8D5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm42421F6X8D5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm42421F6X8D5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm42421F6X8D5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm42421F6X8D5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm42421F6X8D5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm42421F6X8D5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm42421F6X8D5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm42421F6X8D5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm42421F6X8D5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm42421F6X8D5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm42421F6X8D5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm42421F6X8D5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm42421F6X8D5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm42421F6X8D5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm42421F6X8D5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm42421F6X8D5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm42421F6X8D5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms