Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933403O08RikF6UK53 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933403O08RikF6UK53 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms