Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7U0

Kcnmb3, Potassium large conductance calcium-activated channel, subfamily M, beta member 3, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb3E9Q7U0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnmb3E9Q7U0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Kcnmb3E9Q7U0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnmb3E9Q7U0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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