Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6S4

Gm17067, Predicted gene 17067, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17067E9Q6S4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm17067E9Q6S4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17067E9Q6S4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17067E9Q6S4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17067E9Q6S4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17067E9Q6S4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17067E9Q6S4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17067E9Q6S4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17067E9Q6S4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17067E9Q6S4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17067E9Q6S4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17067E9Q6S4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17067E9Q6S4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17067E9Q6S4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17067E9Q6S4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17067E9Q6S4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17067E9Q6S4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17067E9Q6S4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17067E9Q6S4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17067E9Q6S4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17067E9Q6S4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17067E9Q6S4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17067E9Q6S4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms