Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
BC005561E9Q5E2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BC005561E9Q5E2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms