Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20518E9Q548 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20518E9Q548 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms