Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Susd1E9Q3H4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms