Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Tarbp1E9Q368 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tarbp1E9Q368 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms