Protein–RNA interactions for Protein: E9Q271

Wdr17, WD repeat domain 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr17E9Q271 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Wdr17E9Q271 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Wdr17E9Q271 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Wdr17E9Q271 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Wdr17E9Q271 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Wdr17E9Q271 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Wdr17E9Q271 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Wdr17E9Q271 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Wdr17E9Q271 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Wdr17E9Q271 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Wdr17E9Q271 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Wdr17E9Q271 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Wdr17E9Q271 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Wdr17E9Q271 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Wdr17E9Q271 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Wdr17E9Q271 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Wdr17E9Q271 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Wdr17E9Q271 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Wdr17E9Q271 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Wdr17E9Q271 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Wdr17E9Q271 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Wdr17E9Q271 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Wdr17E9Q271 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Wdr17E9Q271 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Wdr17E9Q271 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Wdr17E9Q271 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Wdr17E9Q271 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Wdr17E9Q271 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Wdr17E9Q271 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Wdr17E9Q271 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Wdr17E9Q271 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms