Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0N2

Ptprh, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprhE9Q0N2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprhE9Q0N2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtprhE9Q0N2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtprhE9Q0N2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtprhE9Q0N2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtprhE9Q0N2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprhE9Q0N2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprhE9Q0N2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprhE9Q0N2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprhE9Q0N2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprhE9Q0N2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprhE9Q0N2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprhE9Q0N2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprhE9Q0N2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprhE9Q0N2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprhE9Q0N2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprhE9Q0N2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprhE9Q0N2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprhE9Q0N2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprhE9Q0N2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprhE9Q0N2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprhE9Q0N2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprhE9Q0N2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprhE9Q0N2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprhE9Q0N2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprhE9Q0N2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprhE9Q0N2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprhE9Q0N2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprhE9Q0N2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms