Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rsf1E9PWW9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rsf1E9PWW9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms