Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4931408C20RikE9PWP9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4931408C20RikE9PWP9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4931408C20RikE9PWP9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4931408C20RikE9PWP9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
4931408C20RikE9PWP9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4931408C20RikE9PWP9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4931408C20RikE9PWP9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
4931408C20RikE9PWP9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4931408C20RikE9PWP9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4931408C20RikE9PWP9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4931408C20RikE9PWP9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4931408C20RikE9PWP9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4931408C20RikE9PWP9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4931408C20RikE9PWP9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4931408C20RikE9PWP9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4931408C20RikE9PWP9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4931408C20RikE9PWP9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4931408C20RikE9PWP9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4931408C20RikE9PWP9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4931408C20RikE9PWP9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4931408C20RikE9PWP9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
4931408C20RikE9PWP9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
4931408C20RikE9PWP9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
4931408C20RikE9PWP9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4931408C20RikE9PWP9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4931408C20RikE9PWP9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
4931408C20RikE9PWP9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
4931408C20RikE9PWP9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4931408C20RikE9PWP9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4931408C20RikE9PWP9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4931408C20RikE9PWP9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4931408C20RikE9PWP9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4931408C20RikE9PWP9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4931408C20RikE9PWP9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4931408C20RikE9PWP9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4931408C20RikE9PWP9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4931408C20RikE9PWP9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4931408C20RikE9PWP9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4931408C20RikE9PWP9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms