Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim30bE9PVL6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim30bE9PVL6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms