Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Soga1E1U8D0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Soga1E1U8D0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Soga1E1U8D0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Soga1E1U8D0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Soga1E1U8D0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Soga1E1U8D0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Soga1E1U8D0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Soga1E1U8D0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Soga1E1U8D0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Soga1E1U8D0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Soga1E1U8D0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Soga1E1U8D0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Soga1E1U8D0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Soga1E1U8D0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Soga1E1U8D0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Soga1E1U8D0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Soga1E1U8D0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Soga1E1U8D0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Soga1E1U8D0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Soga1E1U8D0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Soga1E1U8D0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Soga1E1U8D0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Soga1E1U8D0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Soga1E1U8D0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Soga1E1U8D0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Soga1E1U8D0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Soga1E1U8D0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Soga1E1U8D0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Soga1E1U8D0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms