Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim12cD3Z3L3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms