Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms