Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrc5C3VPR6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrc5C3VPR6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrc5C3VPR6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrc5C3VPR6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrc5C3VPR6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrc5C3VPR6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrc5C3VPR6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrc5C3VPR6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrc5C3VPR6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrc5C3VPR6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrc5C3VPR6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrc5C3VPR6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrc5C3VPR6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrc5C3VPR6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrc5C3VPR6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrc5C3VPR6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrc5C3VPR6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrc5C3VPR6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms