Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cttnbp2B9EJA2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cttnbp2B9EJA2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms