Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms