Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms