Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Rd3lB2RV38 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rd3lB2RV38 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rd3lB2RV38 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rd3lB2RV38 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rd3lB2RV38 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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