Protein–RNA interactions for Protein: B2RRF6

Znf518a, Zinc finger protein 518A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518aB2RRF6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf518aB2RRF6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf518aB2RRF6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf518aB2RRF6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf518aB2RRF6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf518aB2RRF6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf518aB2RRF6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf518aB2RRF6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf518aB2RRF6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf518aB2RRF6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf518aB2RRF6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf518aB2RRF6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf518aB2RRF6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf518aB2RRF6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf518aB2RRF6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf518aB2RRF6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf518aB2RRF6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Znf518aB2RRF6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Znf518aB2RRF6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Znf518aB2RRF6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Znf518aB2RRF6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Znf518aB2RRF6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf518aB2RRF6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms