Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms