Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NhsB1AV60 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms