Protein–RNA interactions for Protein: B1AUS7

Ssxa1, Protein SSXA1, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxa1B1AUS7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ssxa1B1AUS7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssxa1B1AUS7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssxa1B1AUS7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssxa1B1AUS7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssxa1B1AUS7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssxa1B1AUS7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssxa1B1AUS7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssxa1B1AUS7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssxa1B1AUS7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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