Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spocd1B1ASB6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms