Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms