Protein–RNA interactions for Protein: A7L9Z8

Atp2c2, Calcium-transporting ATPase type 2C member 2, mousemouse

Predictions only

Length 944 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2c2A7L9Z8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2c2A7L9Z8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp2c2A7L9Z8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp2c2A7L9Z8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp2c2A7L9Z8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp2c2A7L9Z8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2c2A7L9Z8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2c2A7L9Z8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2c2A7L9Z8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2c2A7L9Z8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2c2A7L9Z8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2c2A7L9Z8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2c2A7L9Z8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2c2A7L9Z8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2c2A7L9Z8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2c2A7L9Z8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2c2A7L9Z8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2c2A7L9Z8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2c2A7L9Z8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2c2A7L9Z8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2c2A7L9Z8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2c2A7L9Z8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2c2A7L9Z8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2c2A7L9Z8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2c2A7L9Z8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2c2A7L9Z8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2c2A7L9Z8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2c2A7L9Z8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2c2A7L9Z8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2c2A7L9Z8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2c2A7L9Z8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2c2A7L9Z8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2c2A7L9Z8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms