Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms