Protein–RNA interactions for Protein: A2RSL7

4931406B18Rik, RIKEN cDNA 4931406B18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931406B18RikA2RSL7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
4931406B18RikA2RSL7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
4931406B18RikA2RSL7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4931406B18RikA2RSL7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
4931406B18RikA2RSL7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms