Protein–RNA interactions for Protein: A2J008

Trgv2, MCG146472 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trgv2A2J008 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trgv2A2J008 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trgv2A2J008 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trgv2A2J008 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trgv2A2J008 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trgv2A2J008 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms