Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Samt1A2BED8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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