Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SktA2AQ25 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SktA2AQ25 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SktA2AQ25 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SktA2AQ25 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SktA2AQ25 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SktA2AQ25 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SktA2AQ25 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SktA2AQ25 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SktA2AQ25 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SktA2AQ25 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SktA2AQ25 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SktA2AQ25 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SktA2AQ25 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SktA2AQ25 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SktA2AQ25 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SktA2AQ25 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SktA2AQ25 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SktA2AQ25 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SktA2AQ25 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SktA2AQ25 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SktA2AQ25 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SktA2AQ25 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SktA2AQ25 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SktA2AQ25 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SktA2AQ25 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SktA2AQ25 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SktA2AQ25 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SktA2AQ25 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SktA2AQ25 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SktA2AQ25 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SktA2AQ25 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SktA2AQ25 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SktA2AQ25 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SktA2AQ25 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SktA2AQ25 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms