Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms