Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ambra1A2AH22 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms