Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Frmpd4A2AFR3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms