Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms